敦化正觉寺为东北古刹，始建于清光绪年间。原址坐落在长白山脚下的敖东古城东关，占地面积二公顷。原址房屋共三十二间近七百平方米，当时叫娘娘庙，历代住持有：唯空法师、尊国法师、兴运法师、佛性法师。到二十世纪三十年代末，由兴运法师更名为正觉寺，教派属金顶毗卢派。二十世纪七十年代初，由佛性法师在美国纽约修建正觉寺下院。九十年代初佛性法师回到祖国，中兴正觉，选址敦化六鼎山，恢复重建敦化正觉寺。在佛性法师主持修建下，如今的正觉寺已经是远近闻名的亚洲最大的尼众道场。

1945年，日寇垮台，苏联人进入敦化，正觉寺在伪满州国时已显败象，四周住有许多日本人。信仰东正教的苏联人不懂佛学，误以为寺院是日本人的场所，遂强行进入寺院，杀牛吃肉，衣服、被褥等物资被洗劫一空。众僧人心涣散，相继离去，香火不再，陷入低潮。后来一部分庙堂借给学校作教室，一部分留僧众居住。后由于百废待兴，人口增加，政策不明等原因，当时的正觉寺逐渐的败落了，庙宇因年久失修部分建筑倒塌，附近居民增加，侵占庙堂的事件屡屡发生。到了文化大革命时期及以后，庙宇仅存五间东厢房。虽然敦化市人民政府将其公布为文物保护单位，仍难以抵抗房屋开发大朝的冲击，到上世纪80 年代，正觉寺的原址上已经片瓦无存了。
但形散而神聚，无相而佛存。作为般若之法门，佛教文化之圣地，呼唤正觉寺的振兴重建，始终是兴运法师和佛性法师的心愿。1977年，旅居美国的正觉寺住持释佛性法师，在纽约修建“圆通寺”，后经回国观光和师父的嘱咐，燃起了她振兴正觉寺的心中不灭之火，随即将“圆通寺”更名为“正觉寺下院”，在她的心目中，上院一定要回国建设。1985年8月10日，纽约正觉寺下院开光。佛性法师扬般若之心，发振兴的弘愿，终于在1991年获得圆满正果。时任中国佛教协会会长赵朴初告诉她：“国务院宗教事务局已经批准修复敦化正觉寺!”时年68岁的佛性法师闻听此讯，不顾年事已高，立即竭尽全力，投入到敦化正觉寺恢复重建宏伟大业之中。

1949年后，正觉寺一部分改为学校，不少出家人被硬性规劝还俗。佛性法师等人离开正觉寺去长春般若寺。几年后，又去南京宝花山龙昌寺受戒，受戒完毕，即去江西云居山真如寺，被虚云和尚收为弟子。1973年至加拿大多伦多，1975到美国，在纽约创建正觉寺。
1980年，任纽约正觉寺住持的佛性法师应中国佛教协会会长赵朴初之邀，回国朝拜佛教四大名山，又回吉林省敦化市省亲，于是向赵朴初及政府主管部门郑重提出，回家乡重建正觉寺。通过她本人多方努力和有关部门协助，终于在1992年9月破土动工，1994年9月10日山门及大雄宝殿等建成。1995年10月一期工程基本完成。
1994年大雄宝殿建成时，举行了隆重的开光仪式，赵朴初为大殿题写了楹联，并委托中国佛教协会咨询委员会副会长焕老法师前来祝贺。送来题联的还有上海龙华寺住持明晹法师、上海玉佛禅寺方丈真禅法师、香港佛教联合会会长觉光法师、副会长黄允畋先生等。河北柏林禅寺住持净慧法师、长春般若寺住持成刚法师亲临开光盛典。美国万佛城宣化上人捐赠数万美金支持正觉寺的建设。著名学者、北京大学副校和季羡林先生从传统文化角度对正觉寺的建筑进行了全面论证，并分别题写了中文匾额和梵文匾额。北京大学白化文教授为观音殿提供了三十二应身和五十三参的图像资料。古籍研究专家罗继祖、书法家段成桂和从文俊、著名作家张笑天都题写了楹联。正觉寺的建设得到国内外如此多大德的支持，都是佛性法师的盛德所感。