包头吕祖庙位于内蒙古包头市东河区吕祖庙街，始建于清咸丰末年， 起初只是一个简陋的小庙，同治五年(1866年)扩建，庙号“妙法禅寺”，过去曾被称为包头“十大寺庙之一”。

寺庙的主要建筑为无梁殿宇，砖石券顶，别具一格，建筑布局有五进院落，三层大殿，配殿，禅堂僧舍，库房53间，连同庙门对面的戏台共占地四、五十亩。庙内原有很多壁画，浮雕，金字匾额。主持共传六世，常住和尚十六、七人，农历四月初八日为庙会。十年动乱中庙内文物盗毁一空损失严重。近年来经过多次修复和扩建，成为包头市重要的旅游参观景点之一。

2008年5月28日，因包头市大风起火，部分大殿遭火灾烧毁，但吕祖庙殿安然无恙

目前此庙主持方丈为演培大师，系包头市人民政协委员。