龙穴岛位于珠江口的蕉门、虎门水道出0界处，北距小南沙约 10公里，距广州86公里，西南距新垦镇约6公里。龙穴岛由龙穴岛旅游区、鸡抱沙、孖沙组成。全岛面积为65平方公里，是南沙最大的海岛。
一、龙穴岛旅游区
龙穴岛旅游区过去又称龙穴洲，由龙穴、铜鼓、爻杯组成，面积约2.8平方公里，位于龙穴岛的东部。西北距万倾沙镇10.2公里。龙穴岛旅游区的西北部为河海冲积平原，20世纪50年代后围垦，面积约0.5平方公里。
龙穴岛旅游区原是荒岛，岛上有60多米高的龙穴山，青山环抱，绿树成荫，茫茫江海，日出日落，蔚为奇观。环岛海滩，有天然泳场，间有卵石、贝壳可拾。岛上有古井8口，井水清绿甘甜，苦旱之年不干，大潮上涌不咸。岛四周受海潮冲刷，形成众多的海石洞，称之为鲤鱼宫、虾宫、蟹宫、龙宫、藏宝洞等。海边岩隙，多长古榕树，虽经台风侵袭，仍稳健如初。离岛约200米的巨礁上，有道光年间英国建造的灯塔，退潮时可涉水而至。
相传龙穴岛正南有几个深邃开阔的洞穴，为南海龙王所居。又有传说海上常有龙出没，以岛上的这些洞为穴，这就是龙穴岛或龙穴洲得名的由来。还有传说这些洞穴是明末清初广东著名海盗张保仔的藏宝洞。
古时的珠江口内海要比现在广阔得多，东莞、中山、珠海等市及番禺的很多地方，那时还是一片泽国。到1928年才有几户东莞贫民到此定居。至20世纪80年代有居住人口600多，当时有发电站、农机维修站、旅游社、供销社、水产收购站及日杂店等。岛上土层肥沃，可耕面积0.5平方公里，生产香蕉、大蕉、莲藕等。
龙穴岛旅游区为国营珠江华侨农场和香港广侨旅游贸易公司合资兴办，并以岛名命名。以其海水、海滩、具有神话色彩的近代海蚀洞穴和岛屿、建筑物、及海鲜海味，香大蕉等旅游资源为依托兴办。
旅游区于1980年11月动工兴建，已建成沙滩泳场。龙宫门楼、度假别墅、电子游乐场、海鲜餐厅、铁索桥、观日亭、穿山洞、花洞等设施，广州轮船公司兴建了钢桩泊位码头，确保在四级风浪情况仍能安全锚泊，有轮船、摩托快艇通广州及万倾沙。龙穴岛旅游区风景怡人，岛上旅游资源丰富，游客甚多。
二、孖沙
80年代后在岛的西南方露出相连的两个沙洲，合称孖沙，因大小二沙成村，故名。全沙由二小沙滩组成，为河沙与淤泥混合，高出低潮面0.1～1米。西北东南走向，全长约10公里，总面积约20平方公里。
三、鸡抱沙
鸡抱沙滩涂，在蕉门与虎门二水道出0汇处，北距南沙镇约1公里，外形如鸡抱鱼（河鱼），故名。为河沙、淤泥淤积而成，西北高东南低，中心最长距离约9公里，水深约-0.3米，最深约1.1米。面积约26平方公里。滩涂土层肥沃，生产的甘蔗、莲藕、香蕉、大蕉等产量颇高；低洼水深出还可养殖鱼虾等水产品。
四、龙穴岛有四奇
1、海市蜃楼
明代，龙穴岛属东莞县。在龙穴岛附近海面经常霞蒸雾罩，常有海市蜃楼出现。每逢年初三到初五，东莞人云集虎门的靖康盐场，等待观看岛上空的海市蜃楼，在春雨如烟，水气如幕的时刻，海面上突然出现琼台楼阁、闹市街巷，人来人往的景象。东莞和宝安县志多次记载岛上海市蜃楼奇景：“海市多见靖康场，当晦夜，海光忽生，水面尽赤。有无数灯火往来，螺女鲛人之属，喧喧笑语。闻卖珠鬻锦数钱粮米声，至晓方止”。当时东莞诗人陈靖吉作《靖康海市》诗曰：“海天腥浪如山来，蛮烟瘴雾拨不开；江神无计役风伯，致使蜃气结成楼。台长桥复千万丈，车盖人马相来往，须叟水天同一色，落日照篷渔歌唱。”
因此在明代曾被列为东莞邑中八景之一。从上述可知，靖康海市是当时常见的景观，清代，龙穴岛如新安县（后名宝安县），仍以海市蜃楼列为新安八景。清康熙九年，新安知县李可成咏有《龙穴楼台》诗曰：“海不扬波三十年，蜃龙吐气幻云烟。楼头景色能千态，市上纷嚣别一天。蛟室由来频献瑞，瀛洲无计克留仙。他时还试探龙穴，好向乘槎学汉蓦。”《新安县志》记载：清“顺治九年七月五日，龙穴有九龙飞腾，经臣上村、臣下村，数里而去”。《东莞县志》说这里：“尝有龙出没其间”。民间传说：“龙穴岛是龙族饮水的地方。岛上有一淡水甘泉，每逢-，便有无数蛟龙翻滚，争饮甘泉；龙穴岛也时现时没，若有若无。
如此说来，龙穴岛曾经多次出现海市蜃楼。它的若隐若现，无非在同雨中大海的浪涛击岸而已。至于九龙飞腾的事，恐怕当时曾发生巨大的龙卷风，卷起九条水柱的自然现象。它倒为气象学家提供了气象资料的一则记录。近代以来，龙穴岛的自然环境发生了极其巨大的变化。由于过度围垦及江河水的自然冲积，珠江口内海越来越狭窄，河床淤泥迅猛，靖康海市早已消失的无影无踪。但景色秀丽的龙穴岛仍然深受游客的欢迎
2、奇井
龙穴岛有古井八眼，眼眼出水甘甜，经年不涸。据旧东莞县志称，龙穴岛于古代海上丝绸之路有着重要的作用，过去外国舟船返航，都要在龙穴岛吸取山泉作备用淡水。
3、奇榕
生长在白步梯下的古榕，根扎岩隙沙地，广荫近亩，虽经风浪催袭而始终屹立。
4、奇洞
龙穴岛上的洞鼓山有鲤鱼洞，还有虾洞、蟹洞，更有龙宫、藏宝洞，不但曲折有趣，而且冬暖夏凉。