4500年前，华夏人文始祖“三皇五帝”中的颛顼、帝喾二帝和商中宗太戊均建都、建业、建陵于此，是华夏儿女寻根祭祖的圣地，中华民族传统祭祀文化和姓氏文化发源地，中华文明的发祥地之一。

  3000多年前，殷商王朝的第十代王太戊、第十三代王河亶甲、第十四代王祖已均先后建都于内黄毫城约百余年，称相土或故殷城，早于殷墟。

  汉高祖九年（公元前198年）置县，至今已有2200多年的历史。
魏称黄河以北为内，黄河以南为外，故有内黄、外黄之称。黄河南岸有外黄和小黄，黄河以北称内黄。

  抗日战争时期内黄是冀鲁豫革命边区根据地，被誉为“红色沙区”。
中华人民共和国时期1999年辖4个镇、13个乡。2008年辖6个镇、11个乡。2010年辖2个街道办事处、7个镇、10个乡。