西汉高祖六年（公元前201年）置雩都县，以北有雩山而得名。1957年6月1日起，因字生僻，改“雩都”为“于都”。[2]

建县时幅员辽阔，所辖地域含现瑞金、会昌、石城、宁都、安远和寻乌诸县。素有“六县之母”和“闽、粤、湘三省往来之冲”之称。古时于都曾为赣南的政治、经济、文化、交通中心和军事要地，郡治设在于都近250年之久。苏区时期，先后分设于都、胜利、登贤、瑞西、兴胜、于西等县

中共赣南省委和省苏维埃政府驻于都县城。

公元前201年（西汉高祖六年）建县，迄今已有2214年的历史。是赣南建县最早的三个县之一。建县时幅员辽阔，所辖地域含今宁都、石城、安远、瑞金、会昌、寻乌诸县，故有“六县之母”之称。

三国吴嘉禾五年在白鹿营分设阳都县。

南朝梁大同十年在南乡分设安远县。

五代时分设石城县，南唐保大十一年将瑞金监升为瑞金县。

北宋太平兴国七年在九州分设会昌县。

苏区时期，先后分设于都、胜利、登贤、瑞西、兴胜、于西等县，中共赣南省委和省苏维埃政府驻于都县城。

1949年于都解放。先后属赣西南行政公署、赣南行政公署、赣州专区、赣州地区、赣州市